Набор Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit для систем Illumina предназначен для надежного создания библиотек кДНК для специфичного к цепи РНК-секвенирования на системах секвенирования нового поколения (NGS) Illumina. Этот набор объединяет превосходные характеристики обратной транскриптазы SuperScript IV, магнитных частиц Dynabeads и ДНК-полимеразы Platinum SuperFi, позволяя пользователям получать высококачественные библиотеки, готовые к секвенированию.

Преимущества Collibri Stranded RNA Library Prep Kit

Модули Collibri Stranded RNA Library Prep Kit поддерживают быструю подготовку библиотеки в течение 4,5 часов для библиотек мРНК или целого транскриптома с входным количеством образца РНК, обогащенного мРНК или обедненного рибосомами, 1–25 нг. Мультиплексирование библиотек можно проводить с использованием до 96 одноиндексных или уникальных двухцепочечных праймеров, что позволяет проводить однопроходное или парноконцевое секвенирование. Набор подходит для образцов РНК различного качества, включая образцы FFPE.

Визуальные индикаторы целостности процесса

Для максимального удобства визуальные индикаторы целостности процесса включены на протяжении всего рабочего процесса подготовки библиотеки. Отслеживайте ход создания библиотеки, используя визуальную обратную связь от красителей в критических реагентах. Реакционная смесь меняет цвет в ответ на добавление критических компонентов на каждом этапе, чтобы обеспечить максимальную вероятность успеха подготовки библиотеки. Инертные красители не мешают ферментативным реакциям и не ухудшают результаты секвенирования.

Принцип работы

Полноразмерные адаптеры, совместимые с Illumina, вводятся с помощью ПЦР-амплификации с использованием ДНК-полимеразы Platinum SuperFi для создания одноиндексных или уникальных двухцепочечных библиотек, совместимых с однопроходным или парноконцевым секвенированием. Набор содержит 24 или 96 одноиндексных баркодированных ПЦР-праймеров (i7), предварительно смешанных с универсальным праймером i5, или уникальные двухцепочечные ПЦР-праймеры, которые позволяют мультиплексировать до 96 библиотек. Оптимизированные этапы очистки эффективно удаляют остаточные праймеры и димеры адаптеров/праймеров, сохраняя при этом высокий выход библиотеки.

Для количественной оценки библиотек на основе кПЦР перед переходом к секвенированию рекомендуется использовать сопутствующий продукт Collibri Library Quantification Kit.

Применение

Collibri Stranded RNA Library Prep Kit рекомендуется для:

• Исследований экспрессии генов
• Анализа альтернативного сплайсинга
• Обнаружения и открытия некодирующих РНК
• Идентификации альтернативных сайтов полиаденилирования
• Обнаружения слияния генов
• Обнаружения изоформ транскриптов

Характеристики

Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit