Набор Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit для систем Illumina разработан для надежного создания библиотек кДНК для strand-специфичного РНК-секвенирования (NGS) на системах Illumina нового поколения. Этот набор объединяет превосходные характеристики обратной транскриптазы SuperScript IV Reverse Transcriptase, магнитных частиц Dynabeads и ДНК-полимеразы Platinum SuperFi DNA Polymerase, позволяя пользователям получать высококачественные библиотеки, готовые к секвенированию.

Преимущества Collibri Stranded RNA Library Prep Kit

• Быстрая подготовка библиотек в течение 4,5 часов для мРНК или библиотек всего транскриптома.
• Поддерживает ввод образцов РНК, обогащенных мРНК или с удаленными рибосомами, в количестве 1–25 нг.
• Мультиплексирование библиотек с использованием до 96 однократно индексированных или уникальных двойных индексированных праймеров, что позволяет проводить одно- или двухконцевое секвенирование.
• Подходит для образцов РНК различного качества, включая образцы FFPE.

Визуальный контроль целостности процесса

Для максимального удобства визуальные индикаторы целостности процесса включены во весь рабочий процесс подготовки библиотек. Контролируйте прогресс генерации библиотек, используя визуальную обратную связь от красителей в критически важных реагентах. Смесь для реакции меняет цвет в ответ на добавление критических компонентов на каждом этапе, чтобы гарантировать, что подготовка библиотеки имеет наивысшие шансы на успех. Инертные красители не мешают ферментативным реакциям и не ухудшают результаты секвенирования.

Принцип работы

Полноразмерные адаптеры, совместимые с Illumina, вводятся с помощью ПЦР-амплификации с использованием ДНК-полимеразы Platinum SuperFi DNA Polymerase для создания библиотек с одиночным или уникальным двойным индексированием, совместимых с одно- или двухконцевым секвенированием. Набор содержит 24 или 96 однократно индексированных баркодированных ПЦР-праймеров (i7), предварительно смешанных с универсальным праймером i5, или уникальные двойные индексированные ПЦР-праймеры, которые позволяют мультиплексировать до 96 библиотек. Оптимизированные этапы очистки эффективно удаляют остаточные праймеры и димеры адаптеров/праймеров, сохраняя при этом высокий выход библиотеки.

Для количественного определения библиотек на основе qPCR перед секвенированием рекомендуется использовать сопутствующий продукт Collibri Library Quantification Kit.

Применение

Набор Collibri Stranded RNA Library Prep Kit рекомендуется для:

• Исследований экспрессии генов
• Анализа альтернативного сплайсинга
• Обнаружения и открытия некодирующих РНК
• Идентификации альтернативных сайтов полиаденилирования
• Обнаружения слияния генов
• Обнаружения транскрипционных изоформ

Характеристики

Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit