Набор Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit для систем Illumina предназначен для надежного создания библиотек кДНК для специфичного по цепям секвенирования РНК (RNA-seq) на системах секвенирования нового поколения (NGS) Illumina. Модули объединяют превосходные характеристики обратной транскриптазы SuperScript IV, магнитных частиц Dynabeads и ДНК-полимеразы Platinum SuperFi, что позволяет пользователям получать высококачественные библиотеки, готовые к секвенированию. Набор Collibri Stranded RNA Library Prep Kit поддерживает быструю подготовку библиотеки в течение 4,5 часов для библиотек мРНК или целого транскриптома с входным количеством образца РНК, обогащенной мРНК или рибообедненной РНК, 1–25 нг. Мультиплексирование библиотек можно проводить с использованием до 96 однократно индексированных или уникальных дважды индексированных праймеров, что позволяет проводить однократное или парное секвенирование. Набор подходит для РНК-образцов различного качества, включая образцы FFPE.

Визуальный контроль целостности процесса

Для максимального удобства в рабочий процесс подготовки библиотеки включены визуальные подсказки целостности процесса. Следите за ходом создания библиотеки, используя визуальную обратную связь от красителей в критически важных реагентах. Реакционная смесь меняет цвет в ответ на добавление критических компонентов на каждом этапе, чтобы обеспечить максимальную вероятность успеха подготовки библиотеки. Инертные красители не мешают ферментативным реакциям и не ухудшают результаты секвенирования.

Принцип работы

Полноразмерные адаптеры, совместимые с Illumina, вводятся путем ПЦР-амплификации с использованием ДНК-полимеразы Platinum SuperFi для создания однократно индексированных или уникальных дважды индексированных библиотек, совместимых с однократным или парным секвенированием. Набор содержит 24 или 96 либо однократно индексированных баркодированных ПЦР-праймеров (i7), предварительно смешанных с универсальным праймером i5, либо уникальные дважды индексированные ПЦР-праймеры, которые позволяют мультиплексировать до 96 библиотек. Оптимизированные этапы очистки эффективно удаляют остаточные праймеры и димеры адаптеров/праймеров, сохраняя при этом высокие выходы библиотеки. Для количественной оценки библиотек на основе ПЦР перед переходом к секвенированию рекомендуется использовать сопутствующий продукт — набор Collibri Library Quantification Kit.

Области применения

Набор Collibri Stranded RNA Library Prep Kit рекомендуется для:

Исследований экспрессии генов

Анализа альтернативного сплайсинга

Обнаружения и открытия некодирующих РНК

Идентификации альтернативных сайтов полиаденилирования

Обнаружения слияния генов

Обнаружения изоформ транскриптов

Характеристики

Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit

Формат

Набор