Набор Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit

Набор Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit для систем Illumina предназначен для надежного создания библиотек кДНК для strand-специфичного секвенирования РНК на системах секвенирования нового поколения Illumina (NGS). Этот набор объединяет превосходные характеристики обратной транскриптазы SuperScript IV, магнитных частиц Dynabeads и ДНК-полимеразы Platinum SuperFi, позволяя пользователям получать высококачественные библиотеки, готовые к секвенированию.

Быстрая подготовка библиотек

Модули Collibri Stranded RNA Library Prep Kit поддерживают быструю подготовку библиотек в течение 4,5 часов для библиотек мРНК или целого транскриптома с использованием 1–25 нг мРНК-обогащенного или рибо-обедненного образца РНК. Мультиплексирование библиотек может выполняться с использованием до 96 одно-индексных или уникальных двух-индексных праймеров, что позволяет выполнять однократное или парное секвенирование. Набор подходит для образцов РНК различного качества, включая образцы FFPE.

Визуальные индикаторы целостности процесса

Для максимального удобства визуальные индикаторы целостности процесса включены на протяжении всего рабочего процесса подготовки библиотеки. Следите за ходом создания библиотеки, используя визуальную обратную связь от красителей в критических реагентах. Реакционная смесь изменяет цвет в ответ на добавление критических компонентов на каждом этапе, чтобы гарантировать максимальную вероятность успеха подготовки библиотеки. Инертные красители не мешают ферментативным реакциям и не ухудшают результаты секвенирования.

Принцип работы

Полноразмерные адаптеры, совместимые с Illumina, вводятся посредством ПЦР-амплификации с использованием ДНК-полимеразы Platinum SuperFi для создания одно-индексных или уникальных двух-индексных библиотек, совместимых с однократным или парным секвенированием. Набор содержит 24 или 96 одно-индексных баркодированных ПЦР-праймеров (i7), предварительно смешанных с универсальным праймером i5, или уникальные двух-индексные ПЦР-праймеры, которые позволяют мультиплексировать до 96 библиотек. Оптимизированные этапы очистки эффективно удаляют остаточные праймеры и димеры адаптеров/праймеров, сохраняя при этом высокие выходы библиотек.

Для количественной оценки библиотек на основе qPCR перед секвенированием рекомендуется использовать сопутствующий продукт — Collibri Library Quantification Kit.

Применение

Collibri Stranded RNA Library Prep Kit рекомендуется для:

• Исследований экспрессии генов
• Анализа альтернативного сплайсинга
• Обнаружения и открытия некодирующих РНК
• Идентификации альтернативных сайтов полиаденилирования
• Обнаружения слияния генов
• Обнаружения транскрипционных изоформ

Характеристики

Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit