GeneChip™ Zebrafish Gene 1.0 ST Arrays позволяют:

• Измерять экспрессию по всей длине гена с более высоким разрешением и точностью, чем при использовании классических микрочипов, ориентированных на 3'-конец.
• Получать точные и воспроизводимые данные, используя множественные независимые измерения для каждого транскрипта.

Общая информация

Модельные организмы важны для сравнительных геномных исследований, эволюционной биологии и играют важную роль в расшифровке молекулярных механизмов, лежащих в основе заболеваний человека и улучшения сельскохозяйственных культур. GeneChip Gene 1.0 ST Arrays разработаны для анализа широкого спектра модельных организмов. Эти организмы - последние дополнения к растущему семейству микрочипов для анализа экспрессии генов, предлагающих покрытие всего транскрипта.

GeneChip Gene 1.0 ST Arrays были разработаны в сотрудничестве с исследователями.

Ключевые преимущества

• Максимальное покрытие транскриптов – получайте уверенные измерения экспрессии хорошо аннотированного контента с использованием до 26 зондов на транскрипт.
• Полнотранскриптомный анализ – получайте информацию об изоформах транскриптов, которые можно пропустить при использовании дизайнов, ориентированных на 3'-конец.
• Высокая корреляция данных – достигайте высокой корреляции сигнала между чипами (R > 0.99).

Проверенная производительность

GeneChip Gene 1.0 ST Arrays предлагают покрытие всего транскриптома для выбранных модельных организмов. Все дизайны основаны на последних геномных данных и предлагают самое высокое покрытие зондами (до 26 зондов по всей длине гена). Это обеспечивает точное обнаружение для микрочипового анализа всего транскриптома и обеспечивает более высокое разрешение и точность, чем другие классические решения на основе микрочипов, ориентированных на 3'-конец. Подход к полнотранскриптомному анализу позволяет исследователям обнаруживать множественные изоформы транскриптов, включая те, которые могут быть пропущены при использовании дизайна, ориентированного на 3'-конец, такие как варианты сплайсинга, нетранскрибированные транскрипты, транскрипты с альтернативными сайтами полиаденилирования и усеченные транскрипты.

Комплексные реагенты, программное обеспечение и приборы для оптимальной работы микрочипов

Gene 1.0 ST Array является частью комплексного решения, которое включает реагенты и приборы GeneChip.

Expression Console Software - это простое в использовании приложение, которое позволяет обобщать наборы зондов, а также предварительно оценивать качество данных.

NetAffx Analysis Center с регулярно обновляемыми биологическими и функциональными аннотациями наборов зондов является наиболее полным ресурсом для аннотаций микрочипов и информации о последовательностях зондов. Гибкие инструменты запросов и внешние ссылки позволяют исследователям углубляться в гены и аннотации, представляющие интерес. Этот ресурс позволяет легко интерпретировать результаты микрочипов и быстро разрабатывать последующие исследования.

Рабочий процесс

Исследователи также могут использовать IGB для визуализации результатов в геномном контексте. Геномные аннотации, включая последовательности RefSeq, SNP и геномные местоположения из различных источников, можно просматривать вместе с данными о сигнале экспрессии генов микрочипов.

Анализ данных Gene 1.0 ST Array аналогичен анализу экспрессии генов 3', с использованием Expression Console 1.1, стороннего программного обеспечения, совместимого с GeneChip, и инструментов аннотации в NetAffx Analysis Center и IGB.

Профиль контента

GeneChip Gene 1.0 ST Arrays обеспечивают новейшее покрытие транскрибируемого генома. Мы используем обширный набор источников информации для разработки зондов, которые опрашивают до 26 уникальных последовательностей каждого транскрипта. Вместе эти 26 уникальных 25-мерных зондов опрашивают до 650 оснований на транскрипт. Это высокое покрытие зондами по всему транскрипту приводит к превосходной производительности и уверенности в данных, а также к возможности обновления экспериментальных данных по мере роста понимания каждого генома и транскриптома.

Только для исследовательских целей. Не для использования в диагностических процедурах.