GeneChip™ Rabbit Gene 1.0 ST Arrays позволяют:

• Измерять экспрессию по всему гену с более высоким разрешением и точностью, чем классические микрочипы с 3'-смещением.
• Получать точные и воспроизводимые данные, используя несколько независимых измерений для каждого транскрипта.

Общая информация Модельные и прикладные исследовательские организмы ценны для сравнительных геномных исследований, эволюционной биологии и продолжают играть важную роль в расшифровке молекулярных механизмов, лежащих в основе заболеваний человека и улучшения сельскохозяйственных культур. GeneChip Gene 1.0 ST Arrays были разработаны для анализа широкого спектра модельных и прикладных исследовательских организмов. Эти организмы являются последними дополнениями к растущему семейству микрочипов для анализа экспрессии генов, предлагающих покрытие всего транскрипта. GeneChip Gene 1.0 ST Arrays были разработаны в сотрудничестве с влиятельными исследователями, такими как Алан Арчибальд, глава отдела генетики и геномики в Институте Рослина (дизайн Porcine Array), Леонард Зон, директор программы исследований стволовых клеток, и И Чжоу, директор Genomic Core программы исследований стволовых клеток в Детской больнице Бостона и Гарвардской медицинской школе в Бостоне (дизайн Zebrafish Array). Ключевые преимущества

• Максимальное покрытие транскрипта – получайте уверенные измерения экспрессии хорошо аннотированного контента с до 26 зондов на транскрипт.
• Анализ всего транскриптома – захватывайте изоформы транскриптов, которые можно пропустить при использовании дизайнов экспрессии с 3'-смещением.
• Высокая корреляция данных – достигайте высокой меж- и внутриматричной корреляции сигнала (R > 0,99).

Проверенная производительность от отраслевого стандарта GeneChip Gene 1.0 ST Arrays предлагают покрытие всего транскриптома для выбранных модельных и прикладных исследовательских организмов. Все дизайны основаны на самом последнем геномном контенте и предлагают самое высокое покрытие зондами (до 26 зондов по всей длине гена). Это обеспечивает точное обнаружение для микрочипового анализа всего транскриптома и обеспечивает более высокое разрешение и точность, чем другие классические микрочиповые решения с 3'-смещением на рынке. Подход к анализу всего транскриптома позволяет исследователям обнаруживать множественные изоформы транскриптов, в том числе те, которые могут быть пропущены при использовании дизайна экспрессии с 3'-смещением, такие как варианты сплайсинга, нетранскрипты с полиаденилированием, транскрипты с альтернативными сайтами полиаденилирования и усеченные транскрипты. Полный набор реагентов, программного обеспечения и инструментов для оптимальной работы массива Для удобства и полной поддержки Gene 1.0 ST Array предоставляется как часть комплексного решения, которое включает в себя реагенты и инструменты GeneChip:

• GeneChip WT Sense Target Labeling and Control Reagents. Для получения подробной информации о процедуре анализа и информации о производительности обратитесь к руководству WT Sense Target Labeling Assay Manual.
• GeneChip Fluidics Station 450 для полной автоматической обработки массивов для получения высочайшего уровня воспроизводимости.
• GeneChip Scanner 3000 7G с дополнительным автозагрузчиком для получения изображений массива.

Предлагается несколько инструментов, которые помогут вам в анализе данных, включая программное обеспечение GeneChip Expression Console, NetAffx Analysis Center и Integrated Genome Browser (IGB). Expression Console Software - это простое в использовании приложение, которое позволяет суммировать наборы зондов, а также проводить предварительную оценку качества данных. Простой рабочий процесс позволяет пользователю быстро анализировать данные. Полученные данные могут быть дополнительно проанализированы с использованием программных приложений от поставщиков программного обеспечения, совместимых с GeneChip™. NetAffx Analysis Center с регулярно обновляемыми биологическими и функциональными аннотациями наборов зондов является наиболее полным ресурсом для аннотаций массивов и информации о последовательности зондов. Гибкие инструменты запросов и внешние ссылки позволяют исследователям углубляться в гены и аннотации, представляющие интерес. Этот ресурс упрощает интерпретацию результатов микрочипов и позволяет быстро разрабатывать последующие исследования. Рабочий процесс Исследователи также могут использовать IGB для визуализации результатов в геномном контексте. Геномные аннотации, включая последовательности RefSeq, SNP и геномные местоположения из различных источников, можно просматривать вместе с данными сигнала экспрессии генов микрочипов. Рабочий процесс анализа данных Gene 1.0 ST Array аналогичен рабочему процессу для анализа экспрессии генов 3', с использованием Expression Console 1.1, стороннего программного обеспечения, совместимого с GeneChip, и инструментов аннотации в NetAffx Analysis Center и IGB. Профиль контента GeneChip Gene 1.0 ST Arrays предоставляют новейшее покрытие транскрибируемого генома. Используется полный набор источников информации для разработки зондов, которые опрашивают до 26 уникальных последовательностей каждого транскрипта. Вместе эти 26 уникальных 25-мерных зондов опрашивают до 650 оснований на транскрипт. Это высокое покрытие зондами по всему транскрипту обеспечивает превосходную производительность и надежность данных, а также возможность обновления экспериментальных данных по мере расширения понимания каждого генома и транскриптома.

Только для исследовательских целей. Не для использования в диагностических процедурах.