GeneChip™ Feline Gene 1.0 ST Arrays позволяют:

• Измерять экспрессию по всему гену с более высоким разрешением и точностью, чем классические микрочиповые решения с 3'-смещением.
• Получать точные и воспроизводимые данные, используя множество независимых измерений для каждого транскрипта.

Общая информация

Модельные и прикладные исследовательские организмы ценны для сравнительных геномных исследований, эволюционной биологии и продолжают играть важную роль в расшифровке молекулярных механизмов, лежащих в основе заболеваний человека и улучшения сельскохозяйственных культур. GeneChip Gene 1.0 ST Arrays были разработаны для анализа широкого спектра модельных и прикладных исследовательских организмов. Эти организмы являются последними дополнениями к растущему семейству микрочипов для анализа экспрессии генов, предлагающих охват всего транскрипта. GeneChip Gene 1.0 ST Arrays были разработаны в сотрудничестве с влиятельными исследователями.

Ключевые преимущества

• Максимальный охват транскрипта – получайте надежные измерения экспрессии хорошо аннотированного контента с до 26 зондами на транскрипт.
• Полнотранскриптомный анализ – захватывайте изоформы транскриптов, которые вы можете пропустить при использовании экспрессионных дизайнов с 3'-смещением.
• Высокая корреляция данных – достигайте высокой меж- и внутричиповой корреляции сигнала (R >0.99).

Проверенная эффективность от отраслевого стандарта

GeneChip Gene 1.0 ST Arrays предлагают охват всего транскриптома для выбранных модельных и прикладных исследовательских организмов. Все дизайны основаны на самом последнем геномном контенте и предлагают самое высокое покрытие зондами (до 26 зондов по всей длине гена). Это позволяет проводить точное обнаружение для полнотранскриптомного микрочипового анализа и обеспечивает более высокое разрешение и точность, чем другие классические микрочиповые решения с 3'-смещением, представленные на рынке. Подход полнотранскриптомного анализа позволяет исследователям обнаруживать множественные изоформы транскриптов, включая те, которые могут быть пропущены при использовании экспрессионного дизайна с 3'-смещением, такие как варианты сплайсинга, не-полиаденилированные транскрипты, транскрипты с альтернативными сайтами полиаденилирования и укороченные транскрипты.

Комплексные реагенты, программное обеспечение и инструментальное решение для оптимальной работы чипа

Для удобства и полной поддержки Gene 1.0 ST Array предоставляется как часть комплексного решения, которое включает в себя реагенты и инструменты GeneChip:

• Реагенты GeneChip WT Sense Target Labeling и контрольные реагенты.
• Станция GeneChip Fluidics Station 450 для полной автоматизированной обработки чипов для получения наивысшего уровня воспроизводимости.
• GeneChip Scanner 3000 7G с дополнительным автозагрузчиком для получения изображений чипов.

Программное обеспечение Expression Console - это простое в использовании приложение, которое позволяет проводить суммирование наборов зондов, а также предварительную оценку качества данных. Полученные данные могут быть дополнительно проанализированы с использованием программных приложений от поставщиков программного обеспечения, совместимых с GeneChip™.

NetAffx Analysis Center с регулярно обновляемыми биологическими и функциональными аннотациями наборов зондов является наиболее полным ресурсом для аннотаций чипов и информации о последовательности зондов. Гибкие инструменты запросов и внешние ссылки позволяют исследователям углубляться в интересующие гены и аннотации. Этот ресурс упрощает интерпретацию результатов микрочипов и позволяет быстро разрабатывать последующие исследования.

Рабочий процесс

Исследователи также могут использовать IGB для визуализации результатов в геномном контексте. Геномные аннотации, включая последовательности RefSeq, SNPs и геномные локации из различных источников, могут быть просмотрены вместе с данными о сигнале экспрессии генов микрочипов.

Рабочий процесс анализа данных Gene 1.0 ST Array аналогичен рабочему процессу для анализа экспрессии генов 3', с использованием Expression Console 1.1, стороннего программного обеспечения, совместимого с GeneChip, и инструментов аннотации в NetAffx Analysis Center и IGB.

Профиль контента

GeneChip Gene 1.0 ST Arrays предоставляют новейшее покрытие транскрибированного генома. Мы используем всеобъемлющий набор источников информации для разработки зондов, которые опрашивают до 26 уникальных последовательностей каждого транскрипта. Вместе эти 26 уникальных 25-мерных зондов опрашивают до 650 оснований на транскрипт. Это высокое покрытие зондами по всему транскрипту приводит к превосходной производительности и надежности данных, а также к возможности обновления ваших экспериментальных данных по мере роста понимания каждого генома и транскриптома.